แม้ Onion Browser ดูจะเป็นทางเลือกที่ปลอดภัยสำหรับคนที่ไม่ต้องการถูกติดตามข้อมูลมากมาย
แต่ข้อที่ควรรู้ในการใช้งานแอพพลิเคชั่นตัวนี้ก็ต้องจดจำไว้บ้างเช่นกัน ไม่ว่าจะเป็นการท่องเว็บไซต์ที่จะช้ากว่าปกติ
เมื่อเทียบกับการเล่นผ่านเบราว์เซอร์ธรรมดาหรือเข้า VPN ก็ตาม เพราะมีการเข้ารหัสของแต่ละเส้นทางในระบบของ Tor นั่นเอง
ไปจนถึงการเปิดสื่อต่าง ๆ ที่จะต้องใช้ Tor ก็จะถูกบล็อกไปแบบอัตโนมัติและไม่สามารถเปิดในแอพตัวนี้ได้
เช่นเดียวกับเครือข่ายอินเตอร์เน็ตบางตัวก็อาจใช้งานไม่ได้และต้องยอมรับความเสี่ยงในการเข้าเว็บที่ไม่เหมาะสมอีกด้วย